rRNA作為總RNA中豐富的成員,提供的轉(zhuǎn)錄本信息卻少之又少,且檢測過多會掩蓋其它基因的表達豐度,從而增加低豐度轉(zhuǎn)錄本的檢測難度。因此,通常在測序之前從總RNA樣品中去除rRNA,rRNA去除的效率也被視為z大化讀取到轉(zhuǎn)錄物的關(guān)鍵因素。 rRNA去除試劑盒適用于快速提取植物組織RNA,使用*的裂解液迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,然后用乙醇調(diào)節(jié)結(jié)合條件后,RNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜,DNase直接在柱上消化殘留DNA,再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 去蛋白液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質(zhì)去除, 最后低鹽的RNase free H20將純凈RNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。
rRNA去除試劑盒使用注意事項:
1. 所有的離心步驟均可在室溫完成,使用可容納五十ml 離心管的離心機。
2. 需要自備乙醇,一次性注射器(可選),研缽。
3. 裂解液RLT 和裂解液RLT Plus和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,需要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
4. 植物組織裂解是否充分直接影響到RNA 提取的質(zhì)量和產(chǎn)量,本試劑盒中提供的裂解液RLT,主要成分為異硫氰酸胍,適用于大多數(shù)植物組織的裂解,但有些植物組織(例如玉米的乳白色胚乳)或絲狀真菌,由于次級代謝產(chǎn)物較特殊,異硫氰酸胍使樣品產(chǎn)生固化,導致RNA 無法提取,此時可以向我們索取另一種裂解液RLC,將解決該問題。